Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUCLG2Q96I99 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUCLG2Q96I99 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUCLG2Q96I99 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUCLG2Q96I99 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUCLG2Q96I99 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUCLG2Q96I99 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUCLG2Q96I99 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUCLG2Q96I99 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUCLG2Q96I99 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUCLG2Q96I99 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUCLG2Q96I99 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUCLG2Q96I99 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SUCLG2Q96I99 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUCLG2Q96I99 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms