Protein–RNA interactions for Protein: Q96HM7

PCED1B, PC-esterase domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1BQ96HM7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCED1BQ96HM7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCED1BQ96HM7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCED1BQ96HM7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCED1BQ96HM7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCED1BQ96HM7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCED1BQ96HM7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCED1BQ96HM7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCED1BQ96HM7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCED1BQ96HM7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCED1BQ96HM7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCED1BQ96HM7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms