Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPNQ96H22 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms