Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC41A3Q96GZ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC41A3Q96GZ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC41A3Q96GZ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms