Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDC3Q96F86 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms