Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39LQ96EH5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39LQ96EH5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39LQ96EH5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39LQ96EH5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL39LQ96EH5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL39LQ96EH5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL39LQ96EH5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL39LQ96EH5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms