Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELP4Q96EB1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELP4Q96EB1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ELP4Q96EB1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELP4Q96EB1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELP4Q96EB1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELP4Q96EB1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms