Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTP4Q96DX8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms