Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC11Q96DB2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms