Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM43Q96BQ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM43Q96BQ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM43Q96BQ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms