Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM143Q96AN5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM143Q96AN5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms