Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCE1Q969G3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms