Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP4Q969E2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP4Q969E2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms