Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
RAD50Q92878 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD50Q92878 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms