Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN4Q92575 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms