Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCSTNQ92542 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms