Protein–RNA interactions for Protein: Q92523

CPT1B, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPT1BQ92523 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPT1BQ92523 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPT1BQ92523 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPT1BQ92523 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPT1BQ92523 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms