Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM3CQ92520 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM3CQ92520 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM3CQ92520 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM3CQ92520 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms