Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY2Q8WXA3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY2Q8WXA3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY2Q8WXA3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms