Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC12Q8WVT3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAPPC12Q8WVT3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC12Q8WVT3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC12Q8WVT3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC12Q8WVT3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC12Q8WVT3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC12Q8WVT3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC12Q8WVT3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC12Q8WVT3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms