Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWIST2Q8WVJ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWIST2Q8WVJ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms