Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG1Q8WTW3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COG1Q8WTW3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms