Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEE9

SAP25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25Q8TEE9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAP25Q8TEE9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAP25Q8TEE9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms