Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBA3Q8TBC4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA3Q8TBC4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA3Q8TBC4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA3Q8TBC4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA3Q8TBC4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA3Q8TBC4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA3Q8TBC4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA3Q8TBC4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA3Q8TBC4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms