Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB1

LNX1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX1Q8TBB1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNX1Q8TBB1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LNX1Q8TBB1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LNX1Q8TBB1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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