Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFWD2Q8NHY2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFWD2Q8NHY2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms