Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP61Q8NHU2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms