Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLHC1Q8NHS4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLHC1Q8NHS4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLHC1Q8NHS4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms