Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF555Q8NEP9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF555Q8NEP9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF555Q8NEP9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF555Q8NEP9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF555Q8NEP9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF555Q8NEP9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF555Q8NEP9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF555Q8NEP9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms