Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APCDD1LQ8NCL9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APCDD1LQ8NCL9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms