Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAD1Q8NBU5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD1Q8NBU5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms