Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM229BQ8NBD8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM229BQ8NBD8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM229BQ8NBD8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM229BQ8NBD8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM229BQ8NBD8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM229BQ8NBD8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM229BQ8NBD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM229BQ8NBD8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM229BQ8NBD8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM229BQ8NBD8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms