Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C3

TRIML2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML2, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML2Q8N7C3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIML2Q8N7C3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIML2Q8N7C3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms