Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00337Q8N6G1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00337Q8N6G1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00337Q8N6G1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms