Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRACR2BQ8N4Y2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRACR2BQ8N4Y2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRACR2BQ8N4Y2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CRACR2BQ8N4Y2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms