Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIRREL3Q8IZU9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms