Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC170Q8IYT3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms