Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms