Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN4Q8IWV2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN4Q8IWV2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN4Q8IWV2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms