Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC6Q8IVU3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms