Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3FQ8IUX4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBEC3FQ8IUX4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOBEC3FQ8IUX4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOBEC3FQ8IUX4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3FQ8IUX4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3FQ8IUX4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3FQ8IUX4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3FQ8IUX4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3FQ8IUX4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3FQ8IUX4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms