Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LDLRAD3Q86YD5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LDLRAD3Q86YD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms