Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VSIG1Q86XK7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms