Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM135Q86UB9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM135Q86UB9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms