Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP1R42Q7Z4L9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP1R42Q7Z4L9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP1R42Q7Z4L9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP1R42Q7Z4L9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP1R42Q7Z4L9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPP1R42Q7Z4L9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPP1R42Q7Z4L9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPP1R42Q7Z4L9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PPP1R42Q7Z4L9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPP1R42Q7Z4L9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPP1R42Q7Z4L9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPP1R42Q7Z4L9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPP1R42Q7Z4L9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPP1R42Q7Z4L9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP1R42Q7Z4L9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP1R42Q7Z4L9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms