Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG9AQ7Z3C6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG9AQ7Z3C6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATG9AQ7Z3C6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms