Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PREX2Q70Z35 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
PREX2Q70Z35 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms