Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS12Q6ZW61 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms