Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00173Q6ZV60 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00173Q6ZV60 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms