Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC149Q6ZUS6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms